A Educação Física no Ensino Fundamental é realizada em duas aulas semanais para o 6º e 7º ano e em uma aula semanal para o 8º e 9º ano, como também no Ensino Médio; estas sendo, na sua maioria, aulas práticas.

Por questões didáticas, a Educação Física possui o seu conteúdo dividido em etapas, que são:

1ª Etapa: Atletismo;
2ª Etapa: Esporte e Lazer;
3ª Etapa: Esporte e Competição;
4ª Etapa: Ginástica, Lutas e Ritmo.

A partir do 6º ano, a Educação Física ganha um caráter avaliativo, em que os alunos são avaliados de acordo com sua participação durante as aulas, sua assiduidade e os conhecimentos adquiridos. Além disso, os alunos realizam uma autoavaliação no final de cada etapa, que também é levada em consideração na composição da nota final da disciplina.

Nessa etapa do ensino, o Serviço de Educação Física e Desporto – SED realiza os seguintes eventos para os alunos desse nível: Festival de Atletismo e Semana de Integração, Cultura e Esporte (SICE).